O núcleo fundador do LIP em Lisboa foi constituído em 1986 por professores do Instituto Superior Técnico e da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, que corporizaram em Lisboa o desafio de desenvolver em Portugal um grupo de investigação em Física experimental de Partículas ligado ao CERN. Na altura eram uma meia dúzia de investigadores. Hoje somos cerca de uma centena em Lisboa, entre doutorados, estudantes, engenheiros, técnicos e administrativos. Mantendo uma forte ligação ao CERN, nomeadamente com a participação no LHC, a actividade do LIP em Lisboa estendeu-se a grandes experiências de física de partículas espalhadas pelo Mundo e no Espaço, bem como à participação em projectos com a ESA. O Laboratório tem hoje competências tecnológicas de referência e infraestruturas cientificas (electrónica digital, fibras ópticas, física médica) e de computação. Mantém ainda uma forte actividade na ligação à sociedade é à universidade, na divulgação, ensino e formação avançada.